Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CGGBP1Q9UFW8 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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