Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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