Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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