Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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