Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SAMD1Q6SPF0 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD1Q6SPF0 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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