Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HIF1AQ16665 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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