Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RFTN1Q14699 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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