Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.78□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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MKRN4PQ13434 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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