Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXQ1Q9C009 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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