Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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