Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD1Q16676 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXD1Q16676 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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