Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms