Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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