Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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