Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GEN1Q17RS7 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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