Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SCARF1Q14162 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.8 ms