Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBBP4Q09028 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms