Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRAP18433 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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