Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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KRTAP9-3Q9BYQ3 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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