Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
MTMR3Q13615 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MTMR3Q13615 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
MTMR3Q13615 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
MTMR3Q13615 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MTMR3Q13615 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MTMR3Q13615 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
MTMR3Q13615 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
MTMR3Q13615 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms