Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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