Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.7 ms