Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ERVFRD-1P60508 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERVFRD-1P60508 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms