Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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