Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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FOXD1Q16676 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXD1Q16676 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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