Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ECM1Q16610 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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