Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RAPSNQ13702 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAPSNQ13702 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms