Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms