Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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