Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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SNX17Q15036 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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SNX17Q15036 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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SNX17Q15036 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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SNX17Q15036 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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SNX17Q15036 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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SNX17Q15036 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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SNX17Q15036 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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SNX17Q15036 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX17Q15036 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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