Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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MKRN4PQ13434 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MKRN4PQ13434 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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