Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1Q9UJ41 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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