Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP43Q70EL4 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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