Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CCDC85BQ15834 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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