Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCINQ13939 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CCINQ13939 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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CCINQ13939 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CCINQ13939 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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