Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM32Q13049 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM32Q13049 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms