Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-2Q9BYQ4 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms