Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms