Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
FXNQ16595 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FXNQ16595 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
FXNQ16595 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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FXNQ16595 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FXNQ16595 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FXNQ16595 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
FXNQ16595 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
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