Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SF1Q15637 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SF1Q15637 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SF1Q15637 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SF1Q15637 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SF1Q15637 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SF1Q15637 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 437.5 ms