Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL9A3Q14050 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL9A3Q14050 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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