Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUSC3Q13454 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUSC3Q13454 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms