Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SRSF6Q13247 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms