Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms