Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms