Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.2 ms