Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL11Q9Y3B7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL11Q9Y3B7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms