Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms