Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRQQ9UMZ3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms