Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN1Q9ULB1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms